D’infant fou escolà a la capella de música de la catedral de Sogorb. Entre els seus primers mestres cal esmentar V. Lacruz i el seu oncle Jaume Perpiñán. Un cop acabats els estudis, exercí com a organista suplent a Sogorb. El mestre de capella de la catedral de València, J.B. Guzmán, quedà admirat de les qualitats del jove Perpiñán i l’animà a ampliar els estudis musicals. Després d’haver estudiat algun temps a València, el 1886 fou nomenat mestre de capella a Sogorb, càrrec que exercí la resta de la seva vida. La seva producció musical és tota de tipus religiós, escrita per a les necessitats de la capella de Sogorb, a la qual Perpiñán dedicà els seus esforços per millorar-ne el nivell.