Membre d’una nissaga de mestres ebenistes d’art, amb un important taller establert a Barcelona dedicat a la construcció d’instruments, en el qual feu l’aprenentatge el lutier Francisco España. Josep Messeguer construí violins d’estil afrancesat, sense demostrar una gran professionalitat, alguns d’ells amb els riscles incrustats al fons i al tac del mànec, sistema molt estès entre els constructors francesos. A més, feu altres instruments seguint el model napolità, amb un envernissat de poca qualitat. Messeguer tingué molts càrrecs d’importància a la junta del gremi de fusters. El 22 de febrer de 1740 fou nomenat per a presentar davant el rei Felip V les reivindicacions de les institucions catalanes per mantenir els privilegis que tenien concedits.