El 1887 accedí al magisteri de la catedral de Girona, on portà a terme una intensa activitat per a la reforma de la música religiosa al culte, el repertori de la qual canvià profundament. Estudià cant pla i feu freqüents estades a Montserrat, on tingué com a mestre Gregori Maria Suñol. El 1908 deixà temporalment la seu gironina per anar al monestir de Montserrat i, bé que inicialment tenia la intenció d’ingressar a l’orde benedictí, tornà a Girona sense fer-ho. Fou molt actiu i s’implicà decididament en la reforma de la música religiosa, tot assistint a congressos de música sacra, fent conferències i amb la redacció d’articles. Compongué unes 130 obres, entre les quals hi ha misses i motets. Part de la seva producció es conserva a l’arxiu de la catedral de Girona. Rué convertí la capella de música -durant alguns períodes del seu càrrec molt nodrida de membres- en un centre de formació musical de prestigi a les comarques gironines. Foren alumnes seus C. Casademont, T. Sobrequés i J. Saló, entre d’altres. El 1919 es traslladà a la catedral de Tarragona, on substituí R. Maneja. Després de la seva mort, F. Tapies exercí el càrrec de mestre de capella.
- Rué i Rubió, Miquel: La reforma de la música religiosa, Diario de Gerona, Gerona 1900
- Rué i Rubió, Miquel: Canto gregoriano: cooperación a la edición vaticana de los libros de canto litúrgico, Tip. Masó, Gerona 1905