Estudià a París i el 1682 se sap que residia a Marsella, on fou organista i professor d’orgue. El 1684 fundà l’Acadèmia de Música de Marsella, per a la qual cosa abans hagué de demanar permís a G.B. Lulli, fins llavors l’únic amb autorització per a crear una institució d’aquestes característiques. Des d’aquesta acadèmia, Pierre Gautier contribuí a la difusió de l’òpera al sud de França. Debutà com a compositor d’òperes amb Le triomphe de la paix (1685), obra que, juntament amb altres peces escèniques, li proporcionà un èxit notable. Com a director d’òpera escollia molt bé el seu repertori i s’interessava en gran manera per la qualitat de la música, les veus i la posada en escena. Tot i que les seves obres mostren la influència directa de Lulli, també s’hi troben trets més personals, com ara el sentit de la melodia i del ritme, la línia expressiva del baix, la varietat de la seva escriptura imitativa i un ús molt acurat de la instrumentació. Compositor de bon ofici, escriví també música instrumental, sobretot composicions per a clavicèmbal i simfonies per a flauta, violí i baix continu.