El creixement del PNB estonià, que havia arribat l'any 2006 al 10%, va experimentar una autèntica caiguda i el 2009 es va situar, segons les previsions de l'FMI, en un -14%. La crisi econòmica es va convertir, així, en la prioritat i pràcticament l'únic tema de debat al país, que va rebre ajuda de les principals institucions econòmiques mundials per a refer les seves finances.
Entretant, es va desvelar la notícia que els autors del ciberatac que va collapsar Estònia el 2007, durant una forta crisi política amb Rússia, no eren agents del Kremlin, sinó seguidors d'un grup activista pro-Putin. L'experiència del 2007, en què Estònia va rebre ajuda de l'OTAN, ha fet que Tallinn sigui el nou centre de prevenció d'atacs al ciberespai de l'Aliança Atlàntica.
En les eleccions al Parlament Europeu del mes de juny el vencedor va ser el partit Eesti Keskerakond (KE), amb el 26% dels vots i 2 diputats, però la candidatura independent d'Indrek Tarand gairebé va assolir els mateixos vots. El seu diputat electe es va afegir al grup parlamentari dels verds, mentre que els del KE, amb un altre diputat, es van incloure al grup parlamentari dels liberals i demòcrates. El Partit Socialista Europeu i els conservadors també tenen un diputat estonià cadascun.