El descobriment de diferents casos de corrupció al voltant del servei de duanes i de l'organisme de la Seguretat Social, en els quals estaven involucrats el president Otto Pérez Molina i la vicepresidenta Roxana Baldetti, així com diversos ministres i alts càrrecs del Govern, va sacsejar els fonaments institucionals del país i va indignar la població. A mesura que les investigacions avançaven i la Fiscalia General anava admetent els càrrecs contra els imputats, es van produir un seguit de dimissions encadenades, començant per la de la vicepresidenta, al juny, i seguida de la d'altres ministres del Govern, fins que el 3 de setembre va renunciar el mateix president. Entremig Otto Pérez va lluitar per tal d'evitar el seu processament, a la vegada que es resistia a les pressions de l'oposició i de la ciutadania, que amb manifestacions públiques continuades van demanar la seva dimissió. Finalment, a l'agost, el Parlament li va retirar la immunitat, fet que va accelerar el procés judicial que el va obligar a renunciar.
Després, el 4 de setembre va prendre possessió com a president en funcions Alejandro Maldonado, que ja havia succeït al juny Baldetti en la vicepresidència, i un cop salvada la situació institucional el 6 de setembre es van celebrar les eleccions generals. La campanya electoral va estar força condicionada per les disputes entre els partits tradicionals, pels episodis de corrupció i per la necessitat d'una renovació política, que va encarnar l'actor Jimmy Morales com a candidat aliè al sistema. Els resultats no van determinar un presidenciable amb majoria suficient, ja que Morales va obtenir el 24% dels vots, mentre que Sandra Torres, dirigent d'un dels partits tradicionals derivats de la socialdemocràcia, en va treure el 20%, tot just una mica per sobre de Manuel Baldizón, el líder del principal partit de l'oposició. Finalment, en la segona volta celebrada el 25 d'octubre, Morales es va imposar a Torres i al gener havia d'assumir la presidència del país. En el cas de les eleccions legislatives, els resultats van confirmar un cop més la volatilitat del sistema de partits, i això complicarà la governabilitat, ja que demanarà contínues negociacions parlamentàries per a aprovar les accions del Govern.