El Moviment d'Emancipació del Delta del Níger (MEND), que actua als estats petroliers del sud de la federació nigeriana, va anunciar al final d'octubre un alto el foc. La decisió, produïda una setmana després de la trobada entre el president Umaru Musa Yar'Adua i el dirigent del MEND, Henry Okah, obria la porta a una solució negociada d'un conflicte que ha causat la mort de centenars de persones i ha afectat la producció del principal producte d'exportació, el petroli. Fracassada la solució militar, el president Musa Yar'Adua va apostar pel diàleg amb la finalitat de posar fi a un conflicte que provocava pèrdues multimilionàries a les finances públiques. Abans de trobar-se amb Okah, Musa Yar'Adua va decretar una amnistia, a la qual es va acollir el dirigent del MEND, alliberat al juliol, i es va manifestar a favor de millorar els ingressos dels estats petroliers --el Govern està disposat a traspassar als estats el 13% suplementari dels ingressos, que fins ara eren del 10%--. A causa de les accions armades del MEND per reclamar la supressió de l'article de la Constitució del 1999 que estableix que els recursos naturals són propietat de l'Estat federal --segrest de tècnics estrangers i saboteigs de les instal·lacions--, la producció de petroli havia baixat el 30%, la qual cosa va fer que Angola superés Nigèria com a primer exportador de l'Àfrica subsahariana.
A Maiduguri, a l'Estat de Bornu, al nord del país, l'exèrcit i la policia van acabar a sang la revolta dels islamistes de Boko Haram, que reclamaven l'aplicació de la llei islàmica a tot el país i combatien qualsevol presència cultural d'arrels occidentals. En l'operació van morir més de 600 persones, entre elles el cap del moviment, Mohammed Yusuf. Les organitzacions de drets humans van denunciar execucions extrajudicials per part dels militars i policies. Malgrat el seu llenguatge radical i antioccidental, Boko Haram no mantenia vincles amb al-Qaida. L'economia va estar en recessió a causa de la manca d'inversions per la inestabilitat al sud i el descens en la producció de petroli.