Les tensions a l’illa de Zanzíbar, que gaudeix d’una àmplia autonomia, van ser el principal problema al qual es va enfrontar el president del país, John Magufuli, elegit a l’octubre del 2015. Les profundes divergències entre el partit en el poder, Chama Cha Mapinduzi, i la principal formació opositora de l’illa, el Front Cívic Unit (CUF), es van manifestar en les eleccions celebrades al mes d’abril. El candidat del CUF, Seif Sharif Hamad, es va negar a participar-hi, argumentant que havia vençut en la votació anterior, de l’octubre, que havia estat anul·lada per la Comissió Electoral per "irregularitats". En demanar el boicot als nous comicis, Sharif Hamad va deixar el camí lliure al president sortint, Ali Mohamed Shein, del Chama Cha Mapinduzi, que va ser reelegit per a un segon mandat amb el 91% dels vots. Malgrat que el president Magufuli, que també és membre del Chama Cha Mapinduzi, va intentar fer de mediador en el conflicte de Zanzíbar, no va aconseguir cap èxit.
Per contra, el president sí que va aconse guir algunes fites en política econòmica i en el combat contra la corrupció, dues prioritats anunciades en la campanya electoral. Tanzània va créixer a un ritme sostingut del 7% gràcies al dinamisme dels serveis, els minerals i la construcció d’obra pública.