El 1961 es creà la Federación Barcelonesa de Medicina del Deporte, sota la presidència de Joaquim Cabot Boix. Posteriorment, nasqueren les federacions provincials de Girona, Lleida i Tarragona, les quals, en unir-se a la de Barcelona, formaren la Federació Catalana de Medicina de l’Esport. Aquesta entitat donà ben aviat suport assistencial als esportistes a través dels seus centres i organitzà reunions científiques, amb el suport primerament de la Residència Blume i després de l’Institut Nacional d’Educació Física de Catalunya, i diferents congressos de caràcter estatal i internacional. El 1964 edità la revista Apuntes (actual Apunts), la primera publicació periòdica espanyola sobre medicina aplicada a l’esport. Amb el temps, però, va diluir-se en el nucli dels professionals del Centre d’Investigació Mèdic-Esportiu de l’Institut Nacional de Medicina de l’Educació Física i en alguns nuclis aïllats. El 1984, els socis numeraris de l’Acadèmia de Ciències Mèdiques de Catalunya i Balears, Jesús Galilea Muñoz, Josep Estruch Batlle, August Castelló i Roca i Ramon Balius Juli, promogueren la creació de la Societat Catalana de Medicina de l’Esport. L’any següent August Castelló fou escollit president (1985-87). Continua formant part de l’Acadèmia de Ciències Mèdiques, encara que amb personalitat jurídica pròpia i plena capacitat d’actuació en l’àmbit territorial de Catalunya. Han estat presidents Ramon Balius (1987-91), Jesus Galilea (1991-93), Josep M. Vilarrubias (1993-95), M. Assumpció Estruch (1995-97), Ramon Sancho (1997-2002), Ramon Olive (2002-06), Daniel Brotons (2006-11), Juan Garcia-Nieto Portabella (2011-16), Montserrat Bellver (2016-19) i Carles Miñarro (des del 2019).