Fundat el 1980 per fomentar el futbol de base, l’any 1992 es fusionà amb el Club Deportiu Móra d’Ebre, conservant la denominació del primer. El CD Móra d’Ebre, precedent de la població fundat el 1920, començà a competir en campionats comarcals. A l’agost del 1932 inaugurà el camp municipal d’esports i l’any 1954 es fusionà amb el Joventut Esportiva Móra d’Ebre, creat l’any anterior. Al principi dels anys setanta jugà a primera categoria territorial. La temporada 2010-11 jugà a segona territorial. Disposa d’un equip femení i de nombrosos equips de futbol de base.