En col·laboració amb la seva germana Carolina (1870-1945), el 1892 a Mompiano (Brescia) intentà de convertir una antiga escola de pàrvuls, amb gran quantitat de nens i pocs mitjans econòmics, en un jardí d’infants segons les idees de Fröbel; sota la direcció de Pietro Pasquali, fixà un mètode (mètode Agazzi) sorgit de l’observació i l’experiència diàries, presentat al Congrés Nacional de Pedagogia de Torí (1898), on també participà per primera vegada Maria Montessori. El mètode fou ben acollit, però passat el congrés restà oblidat. El mateix any publicà La lingua parlata. Afeccionada a la música, en féu l’eix de l’escola; escriví L’abbici del canto educativo (1908) i Bimbi, cantate (1911). Amb la seva germana, publicà altres obres com L’arte delle piccole mani (1929), Guida per le educatrici dell’infanzia (1932).