Fill del vicecanceller Antoni Agustí, fou sagristà de la catedral de Lleida (1518-24), ardiaca de Benasc i prior de la catedral de Santa Maria de Roda. Proposat per Carles V com a bisbe d’Elna (1544), fou nomenat, abans de prendre'n possessió, bisbe d’Osca i Jaca (1545). L’any següent anà a Trento i fou l’únic bisbe de la península Ibèrica que assistí a les tres etapes del Concili. S'oposà enèrgicament que les sessions fossin transferides a Bolonya. El 1562 anà a Lleida, on, a petició dels canonges, presidí en nom del seu germà Antoni, que n'era bisbe titular, un sínode diocesà. Féu prosperar a Osca el prestigi de la universitat.