Fundat l’any 1945, nasqué amb el nom d’Agrupació Deportiva Balaguer. En el seu debut aconseguí l’ascens de la categoria comarcal i la temporada 1945-46 debutà a primera categoria B. Després d’alguns alts i baixos en què competí a primera A i segona categoria, la temporada 1957-58 debutà a tercera divisió estatal, on jugà en dues etapes més: 1960-63 i 1964-67. Posteriorment retornà a categories territorials i el 1974 adquirí la denominació actual. El 1985 pujà a preferent i el 1987 tornà a tercera divisió. Des de llavors s’hi ha mantingut, a excepció de dues breus estades a primera catalana (1997-98, 2003-04). Ha jugat vint-i-vuit temporades a tercera divisió i fou campió de grup (1991, 2000). També fou subcampió de la Copa Federació Espanyola (1995). La temporada 2000-01 fou la més destacada; guanyà la Copa Catalunya en vèncer el FC Barcelona, i disputà la fase d’ascens a segona divisió B. Disposa d’un segon equip sènior, equip femení, nombrosos equips de futbol de base i secció de futbol sala.