Filla d’Emilio Botín, es formà al Bryn Mawr College i a la Universitat de Harvard (EUA). Del 1980 al 1988 treballà a l’entitat nord-americana JP Morgan. Aquest any tornà a l’Estat espanyol i ocupà diversos càrrecs al Banco Santander, del qual fou vicepresidenta (1994-99). Presidenta de Banesto (2002-10), del 2010 al 2014 dirigí la filial del Grupo Santander a la Gran Bretanya. El 2013 s’incorporà al consell d’administració de The Coca-Cola Company. A la mort del seu pare accedí a la presidència del Grupo Santander (10 de setembre de 2014).