Fill de John Hilton el Vell. El 1626 rebé el grau de batxiller en música al Trinity College de Cambridge, i dos anys després entrà com a clergue i organista a l’església de St. Margaret a Westminster. La seva producció religiosa inclou quatre serveis, un tedèum, cinc anthems i dotze verse anthems, però és molt probable que algunes d’aquestes obres pertanyin al seu pare. Publicà les col·leccions Ayres or Fa La’s for three voyces, el 1627, i Catch as Catch Can, el 1652, selecció que esdevingué molt popular i es reimprimí en diverses ocasions. Altres peces seves són catorze fantasies, danses, cançons i diàlegs dramàtics, gènere aquest darrer del qual fou un dels primers cultivadors a Anglaterra.