Fou fundada per Steve Jobs i John Lasseter, un antic creador d’efectes especials digitals de l’empresa de George Lucas. Després de realitzar diversos curtmetratges, s’associà amb The Walt Disney Company per a produir el primer llargmetratge fet íntegrament per ordinador, Toy Story (1995). A aquest èxit el seguiren d’altres com A Bug’s Life (1998), Monsters, Inc. (2001), Finding Nemo (2003) i The Incredibles (2004). El 2004 decidí finalitzar la seva associació amb Disney, però finalment aquesta companyia adquirí Pixar l’any 2006. Llargmetratges posteriors són Ratatouille (2007), Up (2009), Monsters University (2013), Inside Out (2015), Finding Dory (2016), Coco (2017) i Onward (2020), a més de diverses seqüeles de Toy Story i altres films, i un gran nombre de curtmetratges. El 2020 Ed Catmull i Pat Hanrahan, dos dels primers dissenyadors de l’empresa, reberen el premi Turing, un dels més importants en el camp de la tecnologia, pels efectes visuals desenvolupats a Toy Story.