Per exemple, ATTGC -- CGTTA, o bé, AACGTT en una cadena i TTGCAA a la cadena complementària.

Es consideren les endonucleases naturals més específiques, ja que les seqüències de DNA que poden reconèixer generalment només apareixen un cop en un genoma, atesa la seva gran longitud.

L’associació de sgRNA i Cas es considera una endonucleasa de restricció.

L’eina d’edició genòmica més utilitzada actualment és CRISPR-Cas9.

Les CRISPR es troben aproximadament en el 50% dels genomes seqüenciats de bacteris i en el 90% dels d’arquees. Tenen un paper fonamental com a mecanisme natural de defensa contra patògens similars o idèntics als que prèviament han envaït aquests organismes.

Es tracta d’una sigla procedent de l’anglès clustered regularly interspaced short palindromic repeats (’repeticions palindròmiques curtes agrupades i regularment interespaiades’).