Aquesta església era situada al sud-oest del poble d’Anglesola. El primer esment de l’indret de Paganell és de l’any 1156, en què apareix consignat Pere de Paganell. L’any 1166, dins la vila d’Anglesola, es documenta el carrer de la porta de Paganell. L’església de Sant Pere fou un petit priorat de Santa Cecília de Montserrat, que més endavant acabà unit a Santa Maria de Montserrat. El 1472 rebé la visita d’un delegat de Llorenç Marull, abat de Santa Cecília de Montserrat. El 1547 en tenia cura Joan Palau, beneficiat de Tàrrega. El darrer clergue que consta com a responsable d’aquesta església és Jacint Bisbe, l’any 1626. A partir d’aleshores començà l’abandó i l’enrunament total de les seves construccions.