Aquesta església és situada a la caseria de Colls, al nord del Pont de Montanyana. Es tracta d’un edifici refet al segle XVI. Probablement el lloc anomenat Holus, citat en l’acta de consagració de Sant Martí de Montanyana (1026), es refereix a l’indret de Colls. El primer esment de l’església de Colls és de l’any 1076, en què la senyora Comtessa de Salàs conjuntament amb els seus fills donen com a dot a Miró Gerbert, per raó de matrimoni amb Ava, part del seu alou que tenien als termes de Montanyana i d’Areny, al comtat de Pallars, als vilars i termes de Sanctum Petrum de Quallos i de la Torre de Montanyana.
L’església de Colls depenia de la parròquia de Santa Maria de Claravalls, dins el bisbat d’Urgell.