La capella de Sant Joan es troba a Can Coll, una antiga casa senyorial dels Llançà, amb una majestuosa torre, situada prop de les carreteres de Parets a Bigues i de Granollers a Sabadell. Documentalment, el terme de Lliçà de Vall apareix citat per primer cop en el cartulari de Sant Cugat l’any 946, en la donació d’un alou feta pels esposos Senderet i Elisabet al monestir de Sant Cugat. Tanmateix la primera notícia documental on es fa referència a aquesta capella se situa a l’any 1009, segons la qual Albert Bernat, senyor de Lliçà, féu donació d’un alou i unes vinyes a l’església de Sant Joan.
L’any 1576, Pere Coll edificà la casa senyorial on es trobava la capella, tal com figura en una inscripció feta a la torre de la casa. L’any 1600 es va beneir una capella dedicada a sant Joan, la qual va reemplaçar l’antiga capella romànica dedicada a aquest sant, que havia ocupat aquest lloc des del segle XI.