Aquesta capella d’hospital es trobava en un principi fora de les muralles de la vila dels Prats de Rei, en el raval. Originàriament tingué les funcions assistencials dels hospitals de camí, que després deixà d’exercir.
Les primeres notícies de l’existència d’aquest hospital es remunten a l’any 1295, que un membre de la família Puig del terme de Grevalosa feu diverses deixes a les capelles i els hospitals de la zona compresa entre Grevalosa i els Prats de Rei; entre els hospitals beneficiats figurava l’hospital dels Prats de Rei. Al segle XVII aquesta capella de Sant Joan situada als ravals encara exercia les seves funcions assistencials, amb un sacerdot beneficiat que tenia cura de l’assistència. Després perdé aquest caràcter i restà com a simple capella de la parròquia dels Prats de Rei.