El primer esment, ara per ara, conegut del lloc de Lladorre és de l’any 1146, en l’acta de consagració de l’església de Sant Martí de Cardós o del Pui, en la qual els habitants d’aquesta vila es comprometien a pagar anualment a la nova església, per al seu manteniment, un modi de blat. L’any 1314, en la relació d’esglésies parroquials del deganat de Cardós visitades per delegats de l’arquebisbe de Tarragona consta l’església de Sancti Martini de Ribera Ayque, que, per l’ordre o itinerari de les esglésies visitades, ha de correspondre a Sant Martí de Lladorre, encara que podria tractar-se de Sant Martí de Cardós. Tanmateix, aquesta última no gaudí mai, segons els coneixements actuals, de la categoria d’església parroquial, tot al contrari que l’església de Lladorre. En la visita pastoral del 1575 consta que el teulat de sobre l’altar havia de ser reparat. Actualment aquesta parròquia depèn de l’església parroquial de Llavorsí.