Aquesta església presideix el petit nucli de Sisteró, prop de Pelagalls. L’edifici, que no conserva cap tret romànic, fou renovat a mitjan segle XVIII. El lloc de Sisteró és esmentat des de l’any 1057 i la documentació menciona per primera vegada el castell de Sisteró el 1097.
Santa Maria de Sisteró fou i és sufragània de la parròquia de Pelagalls. És molt probable que la primitiva església de Sisteró fos aixecada en època romànica.