Situada dins l’antic terme del castell de Marró, sobre el monestir de Santa Cecília. Degué ser una de les diverses capelles eremítiques que sorgiren a la muntanya. L’església és esmentada el 1299 com a Sant Miquel de Pena, sobre el monestir de Santa Cecília. Segurament sobre el monestir de Santa Cecília i sota Sant Jeroni hi hagué una església amb aquesta advocació. El 1294 apareix un Sant Miquel que creiem que és aquest mateix.