El lloc d’Altron i la seva església són documentats des de l’inici del segle XII. El primer esment de l’església de Sant Sadurní, dins la Vall d’Àssua data del 1102, en què Sendred feu testament, pel qual deixava diversos béns mobles i immobles a les esglésies de Sant Pere i de Sant Sadurní d’Àssua. L’any 1149, amb motiu de la consagració de l’església del monestir de Gerri, Gacet d’Àssua i el seu germà Oliver donaren al cenobi el capmàs d’Una, a la vila d’Otron; mas confirmat en la butlla del papa Alexandre III de l’any 1164.
Els delegats de l’arquebisbe de Tarragona, en el seu recorregut dels anys 1314-15 per les esglésies parroquials del deganat de Montenartró, visitaren Sant Sadurní d’Altron. En la visita pastoral del 1575 formava part de l’oficialat de Sort, i en la del 1758 es fa constar que l’interior i la sagristia són en mal estat i es dona un termini de sis mesos per fer una sagristia nova. Actualment aquesta església està supeditada a la de Rialb.