Desconeixem l’indret on era construïda aquesta església, ja que no n’ha quedat cap vestigi arquitectònic. Gràcies als documents dels segles XI i XII on apareix relacionada la vila de Cerqueda, es pot establir que devia ser situada entre la vila de Nabiners i les terres meridionals de la vall de Castellbò, ja que apareix com a límit, per ponent o per llevant, respectivament, de tots dos indrets. El primer esment és del 967, en la donació d’una vinya a Santa Maria de la Seu, situada a la vall de Cercheda.
L’església de Santa Eulàlia de Cerqueda es coneix únicament pel testament del 1073 de Seniofred que deixava un sou al seu prevere. En el Spill… del vescomtat de Castellbò, redactat al principi del segle XVI, dins del quarter de Ciutat de la batllia d’Adraén, s’inclou el lloc de la Serqueda, encara que s’especifica que el lloc és del capítol de la Seu; desconeixem, però, si es tracta de la mateixa població, ja que aquesta s’indica com a lloc de la Bastida d’Hortons.