El sistema endocrí es compon de diversos òrgans situats en diferents zones del cos que, llevat de les excepcions, no tenen continuïtat o connexió anatòmica directa entre si, per bé que formen, en conjunt, una unitat funcional.
Tant en la seva situació corporal com en les característiques anatòmiques, cadascun dels òrgans que componen el sistema endocrí presenta determinades particularitats que el diferencien marcadament de la resta. Tanmateix, però, tenen algunes similituds especials des del punt de vista histològic, és a dir, pel que fa a la composició dels seus teixits, ja que gairebé tots els òrgans endocrins són glandulars. Així, en primer lloc, es componen principalment de cèl·lules especialitzades en l’elaboració de determinades substàncies químiques, anomenades hormones, que tenen la funció de regular el metabolisme orgànic. A més, aquestes cèl·lules es troben disposades de manera que tenen a prop algun vas circulatori al qual poden secretar directament les hormones produïdes per tal que, a través del corrent sanguini, atenyin els teixits sobre els quals específicament exerciran llur acció.
Els diversos òrgans que componen el sistema endocrí són: l’hipotàlem, la hipòfisi, la tiroide, les paratiroides, el pàncrees, les glàndules suprarenals i, també, les gònades, és a dir, els ovaris en la dona i els testicles en l’home.
D’altra banda, també forma part del sistema endocrí la glàndula pineal o epífisi, una petita estructura localitzada al cervell, sobre els tubercles quadrigèmins. Tanmateix, la seva funció en l’ésser humà és poc coneguda en l’actualitat, encara que no es descarta que pugui tenir una certa relació amb l’activitat del conjunt del sistema endocrí.