L’anàlisi d’esput és una prova que consisteix en l’examen físic, químic i bacteriològic de les secrecions que s’expulsen de les vies respiratòries inferiors amb la tos o quan hom s’escura el coll. Aquest estudi presenta un interès especial per a observar les característiques de les cèl·lules i els microorganismes que pot contenir l’esput. Això no obstant, però, l’examen de les secrecions obtingudes amb expectoració és en general poc útil, perquè acostuma a trobar-se contaminat amb molts microorganismes procedents de la boca i les vies respiratòries superiors. Per aquesta raó l’anàlisi de l’expectoració en aquestes condicions només es considera significativa si s’hi troben microorganismes específics que no formen part de la flora comuna de la boca, com el bacil de la tuberculosi.
Per tal d’efectuar una anàlisi de les secrecions respiratòries sense la possible contaminació de l’expectoració, es pot realitzar igualment una punció transtraqueal, que consisteix en una punció de la tràquea a través del coll per a aspirar les secrecions que s’hi localitzen. Aquesta tècnica pot ésser útil per a diagnosticar el tipus de gèrmens causals d’una infecció respiratòria, com ara una pneumònia.